Title DNA microarray를 이용한 항진균 활성세균Bacillus lentimorbus WJ5의 유전자 발현 분석
Author 이영근 * · 김재성 · 장유신 · 조규성 · 장화형
Address 한국원자력연구소 방사선이용연구부
Bibliography Korean Journal of Microbiology, 39(3),141-147, 2003
DOI
Key Words antifungal activity, Bacillus lentimorbus WJ5, DNA microarray, gamma radiation, mutant
Abstract 여러 항진균 활성 관련 유전자들의 발현 수준을 동시에 연구하기 위하여 DNA microarray를 이용하여 유전자들 의 발현 패턴을 비교 분석하였다. 본 연구에서는 항진균 활성을 가지는 Bacillus lentimorbus WJ5의 genomic DNA 를 무작위하게 제한효소로 절단하여 2,000개의 DNA단편을 microarray하였으며, 감마선(60Co)조사로 유도된 7종 의 항진균 활성 결핍 돌연변이체와 발현양상을 정량적으로 비교하였다. Gene Cluster (Michael Eisen, Stanford Univ.)를 이용한 DNA microarray의 분석 결과, 총 408개의 DNA 단편이 발현되는 것을 확인할 수 있었으며, 이들 중 20개의 DNA 단편이 항진균 활성 결핍 돌연변이체에서 발현이 억제되는 것으로 나타났다. 특히, pbuX (xanthine permease, K222), ywbA (phosphotransferase system enzyme II, K393), ptsG (PTS glucose specific enzyme II ABC component, K877), yufO (ABC transporter(ATP-binding protein), K1301), 그리고 ftsY (signal recognition particle (docking protein), K868)는 모든 돌연변이체에서 동시에 발현되는 down-regulation된 유전자들로서 물질 이동과 관련된 것으로 보고되어 있으며, 항진균 활성 관련 신호 및 물질의 이동에 관여할 것으로 사료되어진다.
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