| Title | Sphingomonas chungbukensis DJ77 균주에서2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase를암호화하는 phnS 유전자의 염기서열과 상동성 분석 | ||
| Author | 엄현주 · 강민희 · 김영필 · 김성재 · 김영창 1 , 2 , * | ||
| Address | 1충북대학교 자연과학대학 생명과학부 ; 2충북대 바이오연구소 | ||
| Bibliography | Korean Journal of Microbiology, 39(3),123-127, 2003 | ||
| DOI | |||
| Key Words | Sphingomonas chungbukensis DJ77, phnS, 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase | ||
| Abstract | Sphingomonas chungbukensis DJ77은 phenanthrene을 단일 탄소원과 에너지원으로 이용하여 살아갈 수 있다. pUPX5는 phenanthrene과 naphthalene 분해를 위해 필요한 2-hydroxychromene-2-carboxylate (HCCA) isomerase를 암호화하는 phnS 유전자를 포함한다. 본 논문에서는 phnS 유전자가 포함된 3271 bp의 염기 서열을 결정하였다. 이 유전자는 ATG를 개시코돈으로 사용하며, TAA를 종결 코돈으로 사용하고 있다. 또한 개시 코돈의 5 bp 앞쪽으 로 GGAA라는 ribosomal binding site를 갖는다. phnS는 총 594 bp의 open reading frame을 포함하며, 158개의 아미 노산으로 구성되었다. phnS를 구성하는 아미노산 서열은 S. aromaticivorans F199의 유사 서열과 87%의 유사성을 나타냈다. phnS 유전자는 biphenyl dioxygenase를 구성하는 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase를 암호화하는 phnQ와 ferredoxin를 암호화 하는 phnR과 같은 operon을 이루며, 이들 유전자의 downstream에 위치하고 있다. | ||
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