Title Benzoate 분해세균 Acinetobacter sp. kS-1에서 분리된 catechol 1,2-dioxygenase의 특성 및 N말단 아미노산 서열 분석
Author 송승열 · 김승일1 · 윤경하 · 오계헌 *
Address 순천향대학교 자연과학대학 생명과학부; 1기초과학지원연구원 프로테옴분석팀
Bibliography Korean Journal of Microbiology, 38(2),74-80, 2002
DOI
Key Words Acinetobacter sp. KS-1, benzoate, catechol 1,2-dioxygenase, MALDI-TOF, PCR
Abstract 단일 탄소원 및 에너지원으로 benzoate를 이용하는 Acinetobacter sp. KS-1에서 분리 정제한 catechol 1,2-dioxygenase (C1,2O)의 특성과 아미노산 서열을 분석하였다. C1,2O는 catechol과 4-methylcatechol에 대해서 효소활성을 나타내었으며, 활성 최적온도는 35℃이고, 활성 최적 pH는 7.5-9.0의 범위 내에 있었다. 효소활성 저해제로서 은, 수은, 그리고 구리는 Acinetobacter sp. KS-1의 C1,2O 활성을 억제하였다. SDS-PAGE에 의해 측정된 C1,2O의 분자량은 약 36 kDa 였으며, N-말단 아미노산 서 열을 분석한 결과, ¹MNYQQIDALVKQMNVDTAKG^20 로 Acinetobacter radioresistens의 C1,2O와 95%의 유사성을 보여주었다. In-gel 아미노산 서열 분석을 위하여 trypsin 처리와 peptide mapping을 실시하였다. MALDI-TOF를 이용하여 trypsin으로 처리된 세 개의 peptide fragment의 분자량을 분석한 결과 966.3 Da, 2081.7 Da, 그리고 1933.8 Da으로 각각 나타났는데, 이는 A. radioresistens의 C1,2O와 내부 서열(¹SQSDFNLRR^9, ¹HGNRPSHVHYFVSAPGYR^18, ¹TIEGPLYVAGAPESVGFAR^19)이 일치하는 것으로 분석되었다. N-말단 서열과 내부 서열을 바탕으로 primer를 제작하여 polymerase chain reaction을 실시하였다.
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