| Title | BLAST/FASTA를 활용한 미생물 유전체 비교용 도구의 개발 | ||
| Author | 태홍석1,2 · 이대상2 · 박완1 · 박기정2 * | ||
| Address | 1경북대학교 자연과학대학 미생물학과; 2(주)스몰소프트 정보기술연구소 | ||
| Bibliography | Korean Journal of Microbiology, 38(4),267-275, 2002 | ||
| DOI | |||
| Key Words | BLAST, comparative genomics, FASTA, GComp, homology | ||
| Abstract | 미생물 유전체 프로젝트의 결과인 유전체 서열에 대해, 비교 유전체 분석을 수행할 수 있는 분석 도구인 GComp를 개발하였다. 이 도구는 국부 상동성 계산을 BLAST나 FASTA를 사용하여 수행한 후에 그 결과를 받아들여, 상동성을 보이는 부분을 분석하고 위치 파악 및 연결한 뒤, 두 유전체간의 상동성 정도를 일목요연하게 보여줄 수 있는 테이블과 파일들을 생성한다. 한편, 그 결과를 그래픽으로 표시하고 전체를 살펴볼 수 있는 인터페이스 기능을 구현하였다. 시험 데이터로 기존의 미생물 유전체 서열을 상대로 분석하면서, 유전체 서열의 핵산 및 단백질 수준에서의 비교분석 결과를 통해 두 유전체에 대한 비교 정보를 효과적으로 확인할 수 있었고, 보다 다양한 분석을 위한 도구 개발의 기준을 설정할 수 있었다. | ||
| Download PDF | Kor_380406_267-275p.pdf | ||