Title Restictoin pattern을 사용한 Sequence database 검색
Author 김진
Address 건국대학교 자연과학대학 전산학과
Bibliography Korean Journal of Microbiology, 34(1-2),6-10, 1998
DOI
Key Words Restictoin pattern을 사용한 Sequence database 검색
Abstract 본 연구의 기본가정은 G_0내의 sequence들은, G₁,G₂내의 sequence들보다 query isolate q와 더 유사하며, G₁내의 sequence들은 G₂내의 sequence들보다 query isolate q와 보다 유사할 것이라는 가정은 실험결과에 영향을 미치는 몇 개의 변수들을 실험에 의해 증명하였다. 보다 많은 restriction site들을 가진 query isolate들이 보다 신뢰성 있는 결과를 가져왔다. 결과의 정확도는 최대 공통 절단점수의 감소에 따라 역시 감소하였다. 일 결과들을 기존의 방법들과 비교했을 때, 직접적인 염기서열의 비교방법보다 정확하지 않으나 낮은 비용과 사용방법의 단순성에 이점이 있다. 본 연구에서 사용된 기법을 PC 상에서 사용하기 위한 작업이 진행 중에 있다.
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