Title 서열정렬 알고리즘과 유전체 연구에의 응용
Author 박기정
Address 생명공학연구소 유전체사업단 유전체정보팀
Bibliography Korean Journal of Microbiology, 34(1-2),11-19, 1998
DOI
Key Words 서열정렬 알고리즘과 유전체 연구에의 응용
Abstract 하나의 유전자 분석을 위해 데이터베이스를 대상으로 수십만의 sequence alignment를 수행하는 것은 일반적으로 사용되고 있다. 한편, 상동성 분석을 통해 발견할 수 있는 기능 연관성은 일부에 지나지 않는다. Weak homology를 검출할 수 있는 열쇠는 scoring matrix에 있고, 이러한 scoring matrix의 개량과 sequence alignment 알고리즘은 순환적으로 연관되어 있다. 유전체 연구의 병목이자 주 방법론이 될 유전자 분석의 효율성은, 가장 고전적임 alignment 알고리즘 이론의 개량과 응용 프로그램 수준에서의 알고리즘 개량이라는 두 가지 문제와 깊이 관련되어 있는 것이다.
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