Title 해양퇴적물의 핵산추출물에서 humic substances의 효율적인 제거방법
Author 이정현 * · 신현희 · 이홍금 · 권개경 · 김상진
Address 한국해양연구소 생물부 미생물연구실
Bibliography Korean Journal of Microbiology, 34(3),132-136, 1998
DOI
Key Words DNA extraction, humic subsances, marine sediment, 16S rRNA
Abstract 자연환경의 미생물군집을 분자생태학적 방법으로 분석하기 위해서는 오염되지 않은 순수한 핵산의 분리가 필요하다. 해양퇴적물에서 핵산을 추출할 때 같이 추출되는 부식물질(humic substances)은 핵산중폭반응을 저해하기 때문에, 이를 제거하기 위한 네 가지의 방법, 아가로즈젤 전기영동후 용출, Sephadex G-75 젤, Hydroxyapatite 젤, 그리고 PVPP(poluvinylpolypyrrolidone) microspin column 방법에 대해 그 효율성을 비교하였다. 조산된 방법 중에서 PVPP microspin column을 이용하면 건조 퇴적물 1g당 4.8㎍의 순수한DNA를 신속하고 간편하게 얻을 수 있었고, 이 방법으로 분리된 DNA를 PCR의 주형으로 사용한 결과 16S rRNA 유전자의 거의 전 범위에 해당하는 1.5kb 크기의 PCR 산물을 얻을 수 있었다.
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