| Abstract |
세균의 RNA 중합효소에서 여러 σ인자들 간에 보존된 아미노산 서열중 2.3 부위와 4.2 부위의 아미노산 서열로부터 유추하여 두가지의 PCR primer를 제작하였다. 이들을 이용하여 PCR을 수행하였을 때, E. coli와 Streptomyces coelicolor의 DNA로부터 예상되었던 480bp 정도의 DNA가 증폭되는 것을 관찰하였다. E. coli DNA에서 증폭된 DNA를 클로닝하여 염기서열을 결정한 결과 E. coli의 rpoS 유전자로부터 유래하였음을 알았다. 이를 탐침으로 S, coeliicolor에서 genomic DNA hybridization을 수행하였을 때, PvuII 절편 두가지(3.5kb, 2.0kb)와 SalI 절편 두가지 (3.4kb, 1.5kb)에 탐침이 결합하는 것을 관찰하였다. 3.5kb의 PvuII 절편을 sublibrary로부터 클로닝하고, 탐침이 결합하는 1.0kb의 BammHI/HincII 절편의 염기서열을 분석하였다. 부분적으로 결정된 염기서열을 BLAST 프로그램을 이용하여 GenBank와 EMBL, PDB 등의 data library의 유전자들과 비교하여 본 결과 Streptomyces속의 σ인자 들을 비롯한 Synechococcus종, Anabaena종, Pseudomonas aeruginosa, Stigmatella aurantica등의 주된 σ인자와 높은 유사성을 보였다. 현재까지 1.2부위와 4부위에 해당하는 부분의 염기서열을 결정하였는데, 이 부분은 S. Coelicolor에서 알려진 다섯가지의 σ인자 유전자 중 hrdA와 가장 높은 유사성을 보이며, 아미노산의 유사성이 1.2부위에서는 88%, 4 부위에서는 75%인 것으로 나타났다. |
