Title 대장균 내에서 불안정한 Minisatellite DNA 영역의 클론닝 및 DNA 염기서열 결정
Author 임선희 · 김재우 1 · 김광섭 · 정윤희 · 윤세련 · 배호정 · 안태진 · 선우양일 *
Address 동아대학교 자연과학대학 생물학과; 1동아대학교병원 임상병리실
Bibliography Korean Journal of Microbiology, 40(2),65-72, 2004
DOI
Key Words high GC region, minisatellites, unclonable DNA
Abstract 진핵생물의 특정 염기배열을 원핵생물 내에서 증폭시킬 때 불안정성이 비교적 빈번히 관찰되어진다. 특히 long inverted repeats나 AT-rich sequences 그리고 Z-DNA와 같은 구조를 지닌 염기배열은 대장균 내에서 매우 불안정하다. 이러한 염기서열은 대장균 내에서 부분적으로 결실되거나 완전히 손실된다. 본 연구실에서 human SCK1 유전자에 존재하는 몇 개의 tandem repeat (TR)에 대하여 다형성을 조사하였을 때, 어떤 TR 부분은 플라스미드로부터 빈번히 결실되어 그에 대한 염기서열 결정이 어려웠다. 그 결과 이러한 부분은 클론닝될 수 없는 염기서열로 남게 되었다. 본 연구에서는 클론닝이 어려운 두 개의 TR 영역을 저온에서 클론닝하고 nebulizer나 sonicator를 이용하여 두 개의 library를 만들어 DNA 염기서열을 결정하였다. 이러한 연구는 복잡한 고등생물의 게놈연구에서 불안정한 게놈 부분의 염기서열을 결정하는데 도움을 줄 것으로 사료된다
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