| Title | REP-PCR을 이용한 국내 사람과 동물유래 Staphylococcus aureus 분리주의 Molecular Typing | ||
| Author | 우용구1,* and 김신2 | ||
| Address | 1서울대학교 실험동물자원관리원, 2안동대학교 미생물학과 | ||
| Bibliography | Korean Journal of Microbiology, 41(1),60-66, 2005 | ||
| DOI | |||
| Key Words | animal, REP-PCR, S. aureus, SID, RAPD | ||
| Abstract | 국내산 한우, 흑염소, 돼지, 개, 닭 및 마우스 등을 포함한 각종 동물과 사람환자에서 분리된 MRSA 균주를 포함 하여 총 116 주의 S. aureus 균주를 확보하여 이들 균주들의 유전학적 다양성을 분석하고자 시도하였다. 이를 위 하여 쉽고, 편리하며 많이 활용되고 있는 PCR을 이용하여, 개별 분석기법에 따른 유전학적 특성을 파악하는 것 은 물론 활용한 기법들 중에서 유전자 수준에서 가장 효율적이며 뛰어난 감별능력을 지닌 기법을 선발하고자 하 는데 궁극적인 목적을 두었다. 이를 위해서 통계학적인 수치에 따라 객관적인 분석방법으로서 Simpson''s index of diversity (SID)를 산출하여 성적상호간을 비교 및 평가하였다. 공시한 총 99 주에 대한 4M primer를 이용한 RAPD 성적에 근거하여 산출한 SID 값은 0.915의 양호한 값이 산출되었다. 같은 방법으로 총 98 주에 대한 RA primer를 이용한 RAPD 성적을 토대로 산출한 SID 값은 0.874로 확인되었다. 한편 총 107 주에 대한 ERIC-PCR 을 수행한 종합분석 성적에서 공시균주들은 모두 10 종의 유전형(genotype)으로 구분되었고, EM-type에는 14 주 가 포함되어 가장 대표적인 유전형으로 분류되었으며, 이 그룹에는 사람유래의 6 주가 포함되어 가장 지배적인 유전형으로 확인되었다. 또한 DNA profile에 근거한 덴드로그람을 작성하고 SID 값을 산출하였던 바, SDI 0.929 의 신뢰도 높은 성적을 산출하였다. 반면에 공시한 총 108 주의 S. aureus 균주에 대한 종합적인 REP-PCR 성적에 서 모두 20 종의 유전형으로 세분되었고 RB-type은 17 주로 가장 많은 균주가 포함되었다. 작성된 덴드로그람 성 적에서 산출한 SID 값은 우리의 연구에서 수행한 PCR에 기초한 유전자 분석기법들 중에서는 가장 높은 0.930으 로 확인되었다. 결론적으로 RAPD 기법 중에서는 4M primer를 활용한 RAPD가 보다 효율적임을 확인할 수 있었 고, REP-PCR과 ERIC-PCR의 양자의 성적은 거의 비슷하여 적용했던 PCR 분석기법 중에서는 이들 분석기법이 가장 우수한 감별능력을 확보한 분석법으로 최종 선발할 수 있었다. | ||
| Download PDF | 41(1)-10(p.60-66).pdf | ||