| Title | 16S-23S rRNA Intergenic Spacer Region을 이용한 Vibrio ichthyoenteri Species-specific Primer 개발 | ||
| Author | 문영건 and 허문수* | ||
| Address | 제주대학교 해양과학대학 해양생물공학과 | ||
| Bibliography | Korean Journal of Microbiology, 41(2),117-124, 2005 | ||
| DOI | |||
| Key Words | bacterial enteritis, species-specific primer, tRNA gene, Vibrio ichthyoenteri, 16S-23S rRNA ISR | ||
| Abstract | Rotifer와 병든 넙치 자어로부터 분리된 2개의 균주는 표현형적인 특성 확인 결과 Vibrio ichthyoenteri 로 확인이 되었다. V. ichthyoenteri를 검출하기 위해 고감도 PCR 방법 개발을 하기 위해 V. ichthyoenteri 16S-23S rRNA intergenic spacer region(ISR)을 분석하였고, V. ichthyoenteri 종 특이적 primer를 개발하였다. V. ichthyoenteri 의 ISR를 분석한 결과 1개의 다형성 ISR type 서열을 포함하고 있었다. ISR 서열은 길이는 348bp이며 tRNA gene을 가지고 있지 않았다. 이 서열을 가지고 이미 알려진 다른 Vibrio 종의 ISR 서열과 mutiple alignment를 수행한 결과 여러 영역에서 높은 가변성을 나타내어 가변 부위를 표적으로 하여 V. ichthyoenteri를 검출하기 위한 종 특이적 primer를 제작하였다. 제작된 primer의 특이성을 확인하기 위해 Vibrio 표준균주 19종의 genomic DNA와 분리균주 18 group에 genomic DNA 그리고 V. ichthyoenteri와 가장 유사한 서열을 가지고 있다고 알려진 Vibrio 종의 genomic DNA를 가지고 시험하였다. 그 결과 본 연구에서 제작된 종 특이적 primer를 가지고 PCR 반응을 하면 V. ichthyoenteri를 검출 할 수가 있다. K | ||
| Download PDF | 41(2)-06(p.117-124).pdf | ||