Title Streptomyces griseus ATCC10137에서 Trypsin 유전자 sprT의 주변 유전자군 분석
Author 지원재, 김미순, 김종희, 강대경1, and 홍순광*
Address 명지대학교 생명과학과, 1㈜이지바이오시스템 중앙연구소
Bibliography Korean Journal of Microbiology, 41(4),255-261, 2005
DOI
Key Words ArsR, oxidoreductase, lipoprotein, peptidoglycan bound protein, SGT, transmembrane protein
Abstract Streptomyces griseus trypsin(SGT)을 코드하는 sprT 유전자를 포함하여 약 6.7 kb의 DNA 단편을 Streptomyces griseus ATCC 10137의 염색체 DNA로부터 클로닝 하여 염기서열을 결정하였다. 염기서열 분석 결과, 염색체 DNA를 EcoRI-HindIII 제한효소로 완전 분해하여 클로닝한 약 6.7 kb의 단편에는 sprT 유전자를 포함하여 총 6개의 완전한 ORF (open reading frame)와 1개의 불완전한 ORF가 존재하는 것으로 밝혀졌으며, 순서대로 ORF1, SGT, ORF2, ORF3, ORF4, ORF5, ORF6로 명명 하였다. 예상 단백질의 아미노산 서열 분석 결과, ORF1은 oxidoreductase, ORF3는 ArsR family의 transcription regulator, ORF4는 Listeria monocytogenes의 LPXTG motif를 갖는 peptidoglycan bound protein, ORF5는 transmembrane helix를 갖는 막단백질, ORF6는 Streptomyces avermitilis에서 보고된 lipoprotein과 높은 상동성을 보였으며, ORF2는 기능을 예측 할 수 없었다. 이와 같은 분석결과, sprT 유전자 주위에는 세포막 이나 세포벽 구성성분을 코드하는 유전자가 존재하고 있으며, 따라서 SGT protease 는 이러한 세포막 또는 세포벽 합성이나 분해과정에서 어떤 기능을 담당할 가능성이 있는 것으로 추측되었다.
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