Title 구름버섯균 KN9522에서 degenerate primer를 이용한 Mn-Peroxidase동위효소 유전자들의 PCR 클로닝
Author 전상철 and 김규중*
Address 강릉대학교 자연과학대학 생물학과
Bibliography Korean Journal of Microbiology, 42(1),77-81, 2006
DOI
Key Words degenerate primer, Mn-peroxidase, Trametes versicolor
Abstract 구름버섯균 KN9522로부터 분리한 Mn-peroxidase동위효소 CVMP1, CVMP2, CVMP3 및 CVMP5를 코딩하는 게놈유전자를 분리하기위해 4개의 동위효소 N-말단아미노산 서열을 기준으로 제작한 degenerate primer들이 사용되었다. 하나를 제외한 3개의 동위효소들은 그에 대응되는 염기서열 900정도 되는 PCR산물 (cmp1, cmp2 및 cmp5)을 얻었다. NCBI의 BLAST 프로그램을 사용하여 PCR산물들의 염기서열을 분석한 결과, cmp1, cmp2 및 cmp5는 구름버섯균 PRL572로부터 분리한 유전자 MPG-I (등록번호 Z30668) 및 PGV-II(등록번호 Z54279)와 유사하였다. cmp1과 cmp2는 MPG-I유전자의 염기서열과 각각 77%및 95%의 상동성을 보였고 cmp5는 PGV-II의 염기서열과 88%의 상동성을 보였다. 본 실험을 통하여 저자들은 Mn-peroxidase동위효소계의 아미노산 서열을 기준으로 제작된 degenerate primer들을 사용하여 게놈 DNA조각을 분리할 수 있었다.
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