| Title | Pig6 DNA probe를 기반으로 하는 Prevotella intermedia ATCC 49046 균주-특이 PCR primer 개발 | ||
| Author | 정승우1, 유소영1, 강숙진2, 김미광2, 이광용3, 김병옥1, and 국중기*2 | ||
| Address | 1조선대학교 치과대학 치주과학교실, 2조선대학교 치과대학 구강생화학교실, 3조선대학교 치과대학 치의학과 | ||
| Bibliography | Korean Journal of Microbiology, 42(2),89-94, 2006 | ||
| DOI | |||
| Key Words | detection, DNA probe Pig6, PCR primer, Prevotella intermedia ATCC 49046 | ||
| Abstract | 본 연구는 치주질환 병인론 연구에 빈번히 사용되는 Prevotella intermedia ATCC 49046 균주를 특이적으로 검출 및 동정할 수 있는 PCR primer를 개발하기 위하여 시행하였다. P. intermedia ATCC 49046 유전체 DNA를 추출하고, HindIII 제한효소를 이용하여 무작위 클로닝법으로 유전체 DNA 절편을 얻었다. Southern blot 분석법을 이용하여 DNA 절편의 특이성을 조사하였고, chain termination 법을 이용하여 핵산염기서열을 결정하였다. 이를 바탕으로 PCR primer를 설계하고, P. intermedia ATCC 49046에 대한 균주 특이성 및 검출 한계(민감도)를 조사하였다. Southern blot 분석 결과 Pig6 DNA probe는 서양인에서 분리 동정된 P. intermedia 균주와만 hybridization하였고, 한국인에서 분리 동정된 P. intermedia 균주들과는 반응이 없었다. Pig6 DNA probe는 813 bp의 핵산염기로 구 성되어 있었으며, 이를 바탕으로 설계된 Pig6-F3와 Pig6-R3 primer 쌍에 의해서는 서양 균주에 특이적인 PCR 산물이 증폭되었다. Pig6-60F와 Pig6-770R primer 쌍에 의해서는 P. intermedia ATCC 49046 유전체 DNA에서만 특이적인 PCR 산물이 증폭되었다. 두 가지 primer 쌍들 각각에 대한 P. intermedia 유전체 DNA량의 검출 한계를 알아보기 위한 민감도 실험 결과 두 가지 primer 쌍들 모두 4 pg (약 2000마리) 까지 검출 가능하였다. 이상의 연구결과를 종합하면, Pig6-60F와 Pig6-770R primer 쌍은 P. intermedia ATCC 49046을 균주 특이적으로 동정할 수 있어, 이 균주의 보존적 측면에서 유용하게 이용될 수 있을 것으로 사료된다. | ||
| Download PDF | 42(2)-14(p.89-94).pdf | ||