Title |
송이 자생군락 토양 내 난배양성 세균군집의 계통학적 특성 |
Author |
김윤지1 and 황경숙1,2* |
Address |
1목원대학교 미생물생태자원연구소, 2생명산업학부 |
Bibliography |
Korean Journal of Microbiology, 43(3),201-209, 2007 |
DOI |
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Key Words |
Acidobacteria, forest soil, phylogeny, pine mushroom, VBNC bacterial population |
Abstract |
송이 자생군락 토양 내 세균군집의 정량적 평가를 수행한 결과 CFDA 형광염색법을 이용해 직접 계수된 생균수는 7.4±1.19×108~1.07±0.17×109 cells/g soil로 육즙영양배지(nutrient broth, NB)에서 배양된 생균수는 CFDA 계수치의 5~8%로 계수되었으며, 10-2으로 희석한 NB (DNB)배지에서는 40~47%의 계수치를 나타내었다. 이상의 결과로부터 송이 자생군락 토양 내에는 배양이 곤란한 난배양성(viable but non-culturable; VBNC) 세균이 다수 존재해 있는 것으로 추정되었다. 송이 자생군락 토양 내 세균군집의 계통학적 특성을 검토하기 위해 토양으로부터 직접 DNA를 추출하고 16S rDNA-ARDRA cluster 분석을 통하여 대표 clone의 16S rDNA 염기서열 분석을 수행하였다. 송이 자생군락 토양으로부터 구축된 총 115 clone은 31 ARDRA cluster로 분류되었으며, α-, β-, γ-Proteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria 그리고 Firmicutes의 6개 계통군이 확인되었다. 이들 계통군 중 약 85%가 Acidobacteria 계통군에 속하여 압도적인 우점군임이 확인되어 매우 독특한 계통학적 특성을 나타내었다. |
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