Title C형 간염바이러스(HCV)의 NS5B RNA Replicase에 의해 그 활성이 조절되는 HCV 지놈 표적 Hammerhead 리보자임 개발
Author 이창호 and 이성욱*
Address 단국대학교 자연과학부 분자생물학전공 나노센서 바이오텍 연구소
Bibliography Korean Journal of Microbiology, 43(3),159-165, 2007
DOI
Key Words allosteric ribozyme, communication module, hammerhead ribozyme, HCV IRES, Hepatitis C virus, RNA aptamer
Abstract C형 간염바이러스(hepatitis C virus; HCV) 증식을 효과적이며 특이적으로 제어할 수 있는 유전산물을 개발하기 하여 HCV 증식조절인자인 NS5B RNA replicase 존재에 의해 allosteric하게 그 활성이 조절될 수 있는 HCV internal ribosome entry site (IRES) 표적 hammerhead 리보자임을 개발하였다. 우선 HCV IRES 염기서열 중 +382 nucleotide (nt) 부위가 리보자임에 의해 가장 잘 인식되었음을 관찰하였다. 이러한 allosteric 리보자임은 NS5B RNA replicase와 특이적으로 결합하는 RNA aptamer 부위, aptamer와 NS5B와의 결합에 의해 리보자임 활성을 유도할 수 있도록 구조적 변이를 전달할 수 있는 communication module 부위 및 HCV IRES의 +382 nt를 인지하는 hammerhead 리보자임 등으로 구성되도록 설계하였다. 특히 in vitro selection 기법을 활용하여 NS5B 의존적으로 리보자임 활성을 증가시킬 수 있는 communication module 염기서열을 밝혀내었다. 이러한 리보자임은 단백질이 없거나 대조 단백질인 bovine serum albumin이 존재할 때에는 절단반응을 유도하지 못하였으나 HCV NS5B 단백질이 존재할 때에만 효과적으로 NS5B 농도 의존적으로 절단 반응을 유도할 수 있음을 관찰하였다. 이러한 allosteric 리보자임은 HCV 증식의 효과적인 증식 억제 선도물질 뿐만 아니라 HCV 치료선도 물질의 스크리닝용 도구 및 HCV 조절 인자를 탐색할 수 있는 HCV 진단용 리간드로서도 활용될 수 있을 것이다.
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