| Title | 16S rDNA-DGGE를 이용한 2종의 제주도 해양 해면의 공생세균의 군집 구조 | ||
| Author | 박진숙1*, 심정자2, and 안광득3 | ||
| Address | 1한남대학교 생명공학과, 2한남대학교 생명과학과, 3일본 이화학연구소, BioResource Center | ||
| Bibliography | Korean Journal of Microbiology, 45(2),170-176, 2009 | ||
| DOI | |||
| Key Words | 16S rDNA-DGGE, bacterial diversity, Dictyonella, marine sponge, sponge-associated bacteria, Spirastrella | ||
| Abstract | 제주도에 서식하는 2종의 해양 해면, Dictyonella sp.와 Spirastrella abata의 공생세균 군집구조를 16S rDNA-DGGE (denaturing gradient gel electrophoresis) 방법에 의해 분석하였다. 해면으로부터 total genomic DNA를 추출하여 GC clamp가 추가된 세균에 특이적인 341f primer와 518r primer를 이용하여 16S rRNA gene의 V3 부위를 증폭한 후 DGGE 전기 영동하고 재증폭하여 염기서열을 분석하였다. 그 결과 Dictyonella sp.에서 8개, Spirastrella abata에서 7개의 band를 확인할 수 있었다. 공통된 주요 band가 없는 패턴을 나타내었으며, DGGE band로부터 DNA를 추출하여 부분 염기서열을 분석한 결과, NCBI에 등록된 서열들과 93%~98%의 유사도를 나타내었다. Dictyonella sp.의 주요 해면 공생세균은 uncultured Gammaproteobacteria, Spirastrella abata의 경우 uncultured Alphaproteobacteria, Firmicutes에 각각 포함되어 해면 종에 따른 숙주 특이적 분포를 보이는 것으로 나타났다. | ||
| Download PDF | HM45(2)-12_p.170-176.pdf | ||