| Title | Pectobacterium carotovorum의 검출을 위한 PCR 진단법의 개발 | ||
| Author | 노지나1, 유미선1, 박동석2, 김정구3**, and 윤병수1* | ||
| Address | 1경기대학교 자연과학대학 생명과학과, 2국립농업과학원 농업유전자원센터, 3국립농업과학원 유전자분석개발과 | ||
| Bibliography | Korean Journal of Microbiology, 45(4),306-311, 2009 | ||
| DOI | |||
| Key Words | chinese cabbage, detection, diagnosis, P. carotovorum, soft rot | ||
| Abstract | Pectobacterium carotovorum은 배추를 비롯한 광범위한 식물체에 무름병을 일으키는 병원성 세균으로, 무름병의 효율적인 방제를 위하여 신속한 병원체의 진단이 요구되고 있다. 따라서 본 연구에서는 높은 특이성으로 다양한 진단에 적용되고 있는 PCR법을 이용하여 Pectobacterium carotovorum을 높은 정확성과 민감성으로 검출할 수 있는 진단법을 개발하고자 하였다. 먼저 P. carotovorum에 특이성이 있다고 보고된 다양한 특이 primer들을 비교하여 가장 특이성이 높은 primer쌍들을 선별하였으며, 최종 선발된 특이 primer쌍은 ERB_3F (5'-TGCGACACCTCCTCATCACG-3'), ERB_3R (5'-CTTATCACGCTGTAACCAGC-3')로 나타났다. 이들을 사용한 PCR 검출법은 58oC의 annealing 온도, 15 mM MgCl2 농도 등으로 최적화되었으며, 최적조건에서 P. carotovorum 특이 PCR 진단법은 10 pg, 즉 2×103 copies의 병원균 유전자를 검출할 수 있는 우수한 민감성을 보였다. 또한 배양된 균주가 아닌 현장 시료에서 본 P. carotovorum 검출법을 시험해 본 결과 이 검사법은 병원균 배양없이 현장에도 직접 적용할 수 있음을 입증하였다. 따라서 본 연구를 통해 확립된 P. carotovorum 특이 PCR 진단법은 해당 병원균을 신속하게 진단하는데 유용하게 사용될 수 있을 것이라 기대한다. | ||
| Download PDF | HM45(4)_03_p.306-311.pdf | ||