| Abstract |
제주도에서 채집한 해양 해면 Halichondria panicea의 공
생세균 군집구조를 배양에 의한 ARDRA와 비배양에 의한
DGGE 분석 방법에 의하여 조사하였다. 16S rRNA gene-
ARDRA 분석을 위해 변형된 Zobell 배지와 Marine agar를 이
용하여 120균주를 선별하고 제한효소, HaeIII와 MspI을 사용
하여 ARDRA type을 구분하였다. ARDRA type으로부터 유
래한 16S rRNA gene 염기서열 분석 결과, 알려진 세균 종과
96% 이상의 유사도를 나타내었으며 Alphaproteobacteria,
Gammaproteobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes 등 3문 4강
이 관찰되었다. 그 중 Alphaproteobacteria가 우점하였다. 같
은 해면, H. panicea의 DGGE 분석을 위해 total genomic DNA
로부터 16S rRNA gene를 증폭하여 DGGE fingerprinting을
수행한 결과 14개의 밴드가 관찰되었다. 각 밴드의 16S rRNA
gene 염기서열은 알려진 세균의 염기서열과 100%의 유사성
을 나타내었으며 대부분의 염기서열은 uncultured bacteria에
속하였다. DGGE 분석으로부터 미생물의 군집은 Alphaproteobacteria,
Gammaproteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteira,
Bacteroidetes, Cyanobacteria, Chloroflexi 등 6문 7강으로 나
타났다. ARDRA와 DGGE 방법에 의해 Alphaproteobacteria,
Gammaproteobacteria, Bacteroidetes가 공통적으로 발견되
었으나 전체적인 공생세균의 군집구조는 분석방법에 따라 차
이를 나타내었다. 배양에 의한 방법보다 비배양 방법에서 더
다양한 세균군집구조를 나타내었다. |
