| Title | Firmicutes와 Actinobacteria에 속하는 세균들의 Erm 단백질 in vitro 활성 비교 | ||
| Author | 진형종* | ||
| Address | 수원대학교 융합과학대학 생명공학과 | ||
| Bibliography | Korean Journal of Microbiology, 52(3),269-277, 2016 | ||
| DOI | http://dx.doi.org/10.7845/kjm.2016.6042 | ||
| Key Words | Actinobacteria, Firmicutes, ErmB, ErmC′, ErmE, ErmS, MLSB (macrolide-lncosamide-streptogramin B) antibiotic resistance factor protein | ||
| Abstract | Erm 단백질은 미생물의 23S rRNA의 특정 nucleotide (A2058) 에 methylation 시킴으로써 MLSB (macrolide-lincosamidestreptogramin B) 항생제에 대하여 내성을 나타내는 항생제 내 성인자 단백질이다. 이 단백질들을 계통수분석을 하였을 때 두 개의 주된 집단 즉 항생제 생성균과 병원균으로 각각 구성 된 Actinobacteria와 Firmicutes에서 유래된 단백질로 구분이 된다. 두 집단을 각각 대표하는 2개의 단백질을(항생제 생성 균 유래 ErmS와 ErmE, 병원균 유래 ErmC′와 ErmB) 선택하여 그 활성을 비교하였다. 전체적으로 항생제 생성균에서 비롯된 Erm 단백질이 병원균에서 비롯된 단백질에 비해 높은 활성을 보였다: ErmC′와 ErmE 비교시 9배, ErmB와 ErmS 비교시 13배의 차이가 남. ErmS에서 59개의 아미노산이 제거된 NT59TE 단백질의 활성이 야생형 보다 22.5% 정도에 머물렀기 때문에 이러한 활성의 현격한 차이는 ErmS에서는 N-terminal에 붙어 있는 가외의 아미노산에 의한 것으로 관찰되었고 ErmE에서 는 C-terminal의 가외의 아미노산에 의한 것으로 추정되었다. 그러나 NT59TE가 ErmC′와 ErmB에 비하여 2.2, 3배의 높은 활성을 보이는 것으로 관찰되어 단백질의 핵심부위에서도 높 은 활성을 도와주는 부위가 있음을 알 수 있다. 다중 아미노산 배열 정렬로부터 이 부위는 197RWS199 (ErmS와 ErmE 모두 로부터 유래), 261GVGGSLY267 (ErmS로부터 유래) 그리고 261GVGGNIQ267 (ErmE로부터 유래)와 291SVV293 (ErmS 로부터 유래) 그리고 291GAV293 (ErmE로부터 유래)으로 추 정되었다. | ||
| Download PDF | 52(3)_05_p.269-277.pdf | ||