Title |
Firmicutes와 Actinobacteria에 속하는 세균들의 Erm 단백질 in vitro 활성 비교 |
Author |
진형종* |
Address |
수원대학교 융합과학대학 생명공학과 |
Bibliography |
Korean Journal of Microbiology, 52(3),269-277, 2016 |
DOI |
http://dx.doi.org/10.7845/kjm.2016.6042
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Key Words |
Actinobacteria, Firmicutes, ErmB, ErmC′, ErmE, ErmS, MLSB (macrolide-lncosamide-streptogramin B) antibiotic resistance
factor protein |
Abstract |
Erm 단백질은 미생물의 23S rRNA의 특정 nucleotide (A2058)
에 methylation 시킴으로써 MLSB (macrolide-lincosamidestreptogramin
B) 항생제에 대하여 내성을 나타내는 항생제 내
성인자 단백질이다. 이 단백질들을 계통수분석을 하였을 때
두 개의 주된 집단 즉 항생제 생성균과 병원균으로 각각 구성
된 Actinobacteria와 Firmicutes에서 유래된 단백질로 구분이
된다. 두 집단을 각각 대표하는 2개의 단백질을(항생제 생성
균 유래 ErmS와 ErmE, 병원균 유래 ErmC′와 ErmB) 선택하여
그 활성을 비교하였다. 전체적으로 항생제 생성균에서 비롯된
Erm 단백질이 병원균에서 비롯된 단백질에 비해 높은 활성을
보였다: ErmC′와 ErmE 비교시 9배, ErmB와 ErmS 비교시 13배의 차이가 남. ErmS에서 59개의 아미노산이 제거된 NT59TE
단백질의 활성이 야생형 보다 22.5% 정도에 머물렀기 때문에
이러한 활성의 현격한 차이는 ErmS에서는 N-terminal에 붙어
있는 가외의 아미노산에 의한 것으로 관찰되었고 ErmE에서
는 C-terminal의 가외의 아미노산에 의한 것으로 추정되었다.
그러나 NT59TE가 ErmC′와 ErmB에 비하여 2.2, 3배의 높은
활성을 보이는 것으로 관찰되어 단백질의 핵심부위에서도 높
은 활성을 도와주는 부위가 있음을 알 수 있다. 다중 아미노산
배열 정렬로부터 이 부위는 197RWS199 (ErmS와 ErmE 모두
로부터 유래), 261GVGGSLY267 (ErmS로부터 유래) 그리고
261GVGGNIQ267 (ErmE로부터 유래)와 291SVV293 (ErmS
로부터 유래) 그리고 291GAV293 (ErmE로부터 유래)으로 추
정되었다. |
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52(3)_05_p.269-277.pdf |